前教育部副部长张保庆认为，高等教育的成本核算目前还是一个大难题。对教育成本通行的计算方式有两种：一个叫实付制，即当年搞项目所花的钱都要算在教育培养成本里面；还有一个叫权责制，即把所有用于支持高校发展、所有与学校有关的费用统统计算在里面。实际操作起来非常复杂。
譬如投资一个项目，建教学楼、科研楼或学生宿舍，是要长期使用的，这个成本当然不能集中在新入学的这一两届学生身上，由他们来全部承担，但具体如何来分解？按多少年折旧比较合理，还没有一个比较科学的统一标准；另外，还有校园征地的费用、水电网的铺设、大型科研仪器设备的投入等，这些基础设施的建设费用应该算谁的？
张保庆介绍，对学费有两种核收方法：一种是按实际成本；一种是按日常的运行成本。考虑到中国的国情和成本计算的复杂性，我们选取了后一种办法。
我们对高校生平均年日常的运行经费进行过充分调研，高的超过1.4万元，低的在1万元左右，综合一下，按25%提取，每个学生每学年的学费定在3500元，现行的学费标准就是这样计算出来的。
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