按照教育部的统一规划和部署，2004年重庆市开始实施普通高考自主命题，此项工作的开展得到市政府、市教育行政部门的高度重视，把实施普通高考自主命题作为重庆构建西部教育高地的重要举措；政府有关职能部门大力支持、积极配合，在渝普通高等院校、中学通力合作，在人、财、物等方面给予大力支持；市招考办精心组织、科学实施，用极短的时间，完成了机构、人员、编制的整合，取得了高考自主命题的胜利。
从语、数、英三门课程到全科目的自主命题，三年来的实践证明教育部实施“普通高考分省自主命题”的决策是正确的，自主命题的优势凸显，教育考试改革取得了突破性进展。几年来自主命题工作按照教育部制定的命题指导思想，坚持“三个有利于”，即有利于高校选拔人才、有利于中学实施素质教育、有利于扩大高校办学自主权。随着高等教育改革的深入，特别是高校的扩招，高等教育无论是布局结构，还是规模都发生了很大变化，老百姓比任何时候都更加关注高考。
普通高考命题日益成为一项高风险、高利害工作，做好高考命题被提到政治的高度。分省命题的实施，切实化解了统一、集中命题可能带来的巨大风险；实施自主命题，也兼顾到了东西南北各地的差异，有利于高校选拔人才；分省命题同时有利于各省市统筹基础教育的改革与发展,更好地引导中学实施素质教育；此外，高考分省命题也有力推进了各省市招生考试机构的队伍建设，增强了教育考试机构的核心竞争力。随着高考分省命题改革的深入，管理更加规范、科学，命题质量稳步提高，分省自主命题的优势逐渐显露，其思想已逐步深入人心，得到社会的广泛认同。
普通高考重庆自主命题从起步到现在走过三年的风雨历程，顺利实现从国家卷到地方卷的平稳过渡，并逐渐显露自己的优势和特点：
领导高度重视。分省命题实施以来，市政府多次召集教育行政部门、市招考办、财政局、公安局统一协调部署自主命题工作；召开听证会，听取各方面意见，所需经费纳入经费预算，核定编制、人员；市教育行政部门和市招委联合发文解决命题教师队伍建设，由于领导重视，市招考办领导得力，自主命题工作得以顺利开展。
随着分省自主命题管理办法和实施细则的制订，分省命题逐步从规范命题向科学探究转化。重庆市在实施自主命题中，应用现代信息技术，建立了命题管理应用系统，提高了命题工作的现代化水平，从技术防范的角度强化了安全保密。
严格遵守国家颁布的课程考试大纲，保证了分省命题国家统一考试的性质和质量；同时，重庆市根据本市基础教育的实际，通过试题编制中的情景创设和地方性题材选取，引导考生关注市情、区情，关注重庆的历史与文化，关注时代、关注生活。招生考试机构和普通高等院校更加关注本市基础教育的改革与发展，更加关注基础教育的人才培养，促进了高等教育与基础教育改革与发展的良性互动。
正如自主命题的优越性未充分显示一样，经过三年的自主命题，其实施过程中也遇到了一些问题，归纳起来有三点：其一，高考命题需建立一支素质优良的命题教师队伍，但高校优质教师资源的整合与高校教师面临的繁重教学与科研任务相矛盾，长达一个多月的封闭入闱，使教师队伍的建设和稳定面临困难，必须采取切实有效的办法加以解决；其二，命题的核心有两点，一是如何提高质量，二是如何提高效益。从分省命题实施情况来看，还需要进一步研究如何在节约成本的前提下提高命题质量；其三，从全国范围来讲，大规模泄密风险降低，但由于命题点增多，需要各命题点采取有效措施，确保高考的安全。
在基础教育改革的推进过程中，普通高考分省命题必将逐步步入区域联合、资源共享、互动发展的轨道，同时也将促进全国性资源整合和资源共享，在统一的指导思想、统一的命题原则基础上，各省市结合本地基础教育的实际，统一性与多样化并存。
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