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有关少年班的争论一直不断，近几年来，随着不少大学陆续撤销少年班，人们再次对少年班产生质疑。对此，中科院院士、中国科技大学校长朱清时在接受记者采访时表示，科大少年班办得非常成功，而它从创办时的全国首家，到现在的几乎全国仅存，个中原因值得探讨。
“科大少年班最大的成功在于它的教学模式，”朱清时说，“我们现在的大学，学生一入校大多必须分专业，而少年班采取的模式是学生入学后不分专业，先强化基础课，三年级以后，再自选专业。这样学生才能选准他有天赋且喜欢的专业。任何人干自己喜欢的专业，取得成绩的可能性就大得多。1978年中国科技大学在国内最先创办少年班，至今在已毕业的500名学生中，已有百分之七十多的人被录取为国内外研究生，现已有100多人获得博士学位，已有不少人在各项事业中崭露头角。”
科大少年班成立之初，全国许多大学也曾纷纷仿效，如今它们陆续取消了少年班，为什么科大少年班仍能独树一帜？朱清时认为，关键在于不少学校只是形式上招收了些“小天才”，并没有仿效我们核心的教学模式，因此没有从机制上开发出他们的潜力。
朱清时说，社会上对科大少年班也有不少误解，首先，少年班心理素质问题不像外界所说的那样严重，现在少年班的学生与同级的普通学生大多数只差两三岁，而不是外界想像的五六岁，因此与普通学生的心理差异并不很大。而且少年班的生源选择要经过严格的程序，而不是仅仅凭着智力超长和年龄小。一般来说，对于一些智力特别好的学生，在高二时就可以参加高考了。这些人考过了重点线，就可以报考科大少年班。每年有1000多人过重点线，我们只在其中精选50多名各方面素质优秀的人才。
当然我们也有过经验教训，朱清时接着说，过去不少记者对少年班的报道连篇累牍，甚至经常进入少年班进行采访。在外界超乎寻常的关注下，不少学生精神压力巨大，成绩下滑，以至于舆论开始质疑少年班。现在我们努力为学生创造良好的学习环境，学生几乎不再受打扰。我们还成立了心理咨询中心，及时帮助出现心理问题的学生解决心理难题。
朱清时特别指出，社会对少年班赋予极高的期望是可以理解的，但成果应该是积累出来的，虽然现在少年班毕业生当中已有很多人取得了成绩，但几乎没有超过40岁的，而许多国内外科技大奖的获得者平均年龄在五六十岁以上，因此现在仅仅是他们刚刚开始发挥积极作用的阶段，而不是坐等收获各种奖牌的时候。
朱清时认为少年班并不是“神童流水线”，创办它的目的在于更早地培养出素质全面、适合社会需要的人才。科大少年班成立仅短短二十多年，成绩有目共睹，它的教学模式也在不断改进。目前对于各类少年班的成败得失进行认真总结，有利于把我们的少年班办得更好。
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